上一季末，Peter在Hiro的帮助下毁掉病毒，Hiro将Adam送回过去，一切看似恢复太平...然而，Niki为救Monica消失在爆炸的火光当中，Nathan也在记者会上中弹生死未卜一波未平，另一边Sylar已借Claire的血液重获新生，更加黑暗的旅程才刚刚开始...S3将分两部分呈现给观众---Villains恶人(1-13集)和Fugitives逃亡者(14-25集)英雄们将面临抉择，究…外汇。
