故事发生在第一次地球联合战争爆发8年以后外汇。随着越来越多的资深驾驶员在残酷的战斗中丧身,政府下令十几岁的少年也必须参军《超时空要塞ZERO》。在这样的时代背景下,年轻的联合军驾驶员工藤シン驾驶着爱机F-14出战鲜花。在一次战斗中,工藤不幸迫降在南海的一座孤岛上乙肝。但其实联合军和反联合军双方都探测到了岛上有异常能量反应,而主角却对此浑然不知...... 这部为了纪念MACROSS廿周年的呕心沥血之作的时代背景是初代电视卡通的…《超时空要塞ZERO》。